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法律分析：不办理商标的备案最直接的影响就是其法律的效力，不办理商标备案相当于商标本身不具有合法权，在后续的交易中也是没有任何法律效力的。没有办理备案手续的商标使用许可合同，不能对抗善意第三人。所谓善意第三人，是指对该未备案商标使用许可合同不知情(不知道、不应当知道)的人。不能对抗，是指在先订立的没有办理备案的商标使用许可合同的效力，不能抵抗善意第三人与注册商标人之间就该商标在后所订立合同的效力。
法律依据：《中华人民共和国商标法》
第四条 自然人、法人或者其他组织在生产经营活动中，对其商品或者服务需要取得商标专用权的，应当向商标局申请商标注册。不以使用为目的的恶意商标注册申请，应当予以驳回。本法有关商品商标的规定，适用于服务商标。
第十八条 申请商标注册或者办理其他商标事宜，可以自行办理，也可以委托依法设立的商标代理机构办理。外国人或者外国企业在中国申请商标注册和办理其他商标事宜的，应当委托依法设立的商标代理机构办理。
