淘宝店与快递公司合作有以下几种方式：1. 选择平台物流：淘宝平台提供了与多家快递公司合作的平台物流服务，卖家可以选择合适的快递公司进行合作，通过平台物流进行订单发货和物流追踪。2. 自主选择合作快递公司：卖家可以根据自身需要选择与某家快递公司合作，与快递公司签订合作协议，提供快递公司所需的相关资料，并将订单信息及时提供给快递公司进行发货。3. 地面物流合作：卖家可以选择与快递公司进行地面物流合作，即将商品批量交由快递公司运输，可以获得更优惠的价格或更全面的物流服务。需要注意的是，在与快递公司合作前，卖家需要了解并遵守快递公司的合作要求、费用结算方式以及相关政策规定。
