法律分析：1、限制期限不同。一般而言保护商业秘密的责任是无期限的，而竞业禁止对劳动者的限制一般情况下是指最高在三年内不得从事与原工作有关的行业。
2、保守商业秘密是法定义务，而竞业禁止是由双方约定的义务。
3、通常保守商业秘密用人单位不会支付相应报酬，而竞业禁止用人单位会支付一定的报酬。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》
第二十二条 劳动合同当事人可以在劳动合同中约定保守用人单位商业秘密的有关事项。
第一百零二条 劳动者违反本法规定的条件解除劳动合同或者违反劳动合同中约定的保密事项，对用人单位造成经济损失的，应当依法承担赔偿责任。
