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二者区别如下：
1.实质不同。商标争议实质是对注册商标在先注册人的一项特殊保护措施；商标异议实质是对初步审定的商标所进行的社会异议。
2.申请主体不同。争议人是特定的，即必须是在先注册人；而异议人不是特定的，可以是任何机关、团体、企业或者个人，包括在先注册人。
3.提出时间不同。争议是在被争议商标核准注册，即发给商标注册证五年内提出；而异议是在初步审定，即在《商标公告》上刊登三个月内提出。
【法律依据】
《商标法》第7条，申请注册和使用商标，应当遵循诚实信用原则。商标使用人应当对其使用商标的商品质量负责。各级工商行政管理部门应当通过商标管理，制止欺骗消费者的行为。
